Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc71Q8VEG0 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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