Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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