Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms