Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms