Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms