Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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