Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms