Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Csn1s1P19228 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Csn1s1P19228 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms