Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Irf1P15314 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms