Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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