Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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