Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Usp27Q8CEG8 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Usp27Q8CEG8 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Usp27Q8CEG8 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Usp27Q8CEG8 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Usp27Q8CEG8 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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