Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms