Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Actn1Q7TPR4 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms