Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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