Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nphp4P59240 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nphp4P59240 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms