Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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