Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
VdrP48281 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
VdrP48281 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
VdrP48281 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
VdrP48281 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms