Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NefhP19246 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NefhP19246 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NefhP19246 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NefhP19246 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NefhP19246 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
NefhP19246 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
NefhP19246 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NefhP19246 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms