Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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