Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Trim39Q9ESN2 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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