Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm43806-201ENSMUST00000201766 469 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 E030024N20Rik-201ENSMUST00000075293 494 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm45790-201ENSMUST00000211986 1629 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm43219-201ENSMUST00000197972 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm28307-201ENSMUST00000190685 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Zfp750-201ENSMUST00000092298 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Cga-202ENSMUST00000108130 609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm10043-201ENSMUST00000210691 235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm13666-201ENSMUST00000120032 799 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rtn4Q99P72 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms