Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp20Q8C6M1 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms