Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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