Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Cldn18P56857 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Cldn18P56857 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Cldn18P56857 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Cldn18P56857 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Cldn18P56857 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Cldn18P56857 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Cldn18P56857 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155 ms