Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd8P23463 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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