Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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Ggta1P23336 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ggta1P23336 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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