Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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H2-Q1O19441 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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H2-Q1O19441 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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H2-Q1O19441 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms