Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms