Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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