Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
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