Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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Ccdc18Q640L5 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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