Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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