Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx1P81068 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx1P81068 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms