Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
VdrP48281 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms