Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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