Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Col5a3Q9JLI2 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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