Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
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PtprtQ99M80 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PtprtQ99M80 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
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