Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Atg4aQ8C9S8 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Atg4aQ8C9S8 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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