Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NischQ80TM9 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NischQ80TM9 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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