Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccdc18Q640L5 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccdc18Q640L5 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
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Ccdc18Q640L5 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Ccdc18Q640L5 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccdc18Q640L5 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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