Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Rnf149Q3U2C5 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms