Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Trim71Q1PSW8 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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