Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rps29P62274 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rps29P62274 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms