Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RxraP28700 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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