Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Hoxd9P28357 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Hoxd9P28357 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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