Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Grik3B1AS29 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms