Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SrfQ9JM73 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms