Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rabgef1Q9JM13 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms