Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Top1mtQ8R4U6 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Top1mtQ8R4U6 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Top1mtQ8R4U6 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Top1mtQ8R4U6 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Top1mtQ8R4U6 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Top1mtQ8R4U6 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Top1mtQ8R4U6 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Top1mtQ8R4U6 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Top1mtQ8R4U6 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Top1mtQ8R4U6 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Top1mtQ8R4U6 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Top1mtQ8R4U6 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Top1mtQ8R4U6 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Top1mtQ8R4U6 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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Top1mtQ8R4U6 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Top1mtQ8R4U6 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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